Çocuk bakımının çok eski çağlardan beri bilinmesine karşılık, çocuk hekimliği ayrı bir dal olarak XIX. Yüzyıl ortalarında başlamıştır. Bilinen en eski kuruluş 1769 da Londra’da kurulan çocuk dispanseridir. İlk çocuk hastanesi ise 1802 yılında Paris’te kurulmuştur.
Çocuk hastalar genel nöroşirürji içinde ele alınırken ilk kez Frank Ingraham, Boston çocuk hastanesinde bir pediyatrik nöroşirürji üniti kurdu (1929). Daha sonraları Donald Matson ile ilk pediyatrik nöroşirürji kitabını yayınladı. Bu tarihten sonra pediyatrik nöroşirürjinin kuzey Amerika’da yaygınlaştığı görülmektedir.
Pediyatrik nöroşirürjinin uluslararası organizasyonu 1969’da başladı. Kenneth Schulman, Ernie Mathew ve Bennet Stein pediyatrik nöroşirürji ile ilgilenenlerle yazışarak, 4.Dünya Nöroşirürji Kongresinde bir araya gelerek, resmi bir pediyatrik nöroşirürji birliği kurmayı önerdiler. 1970’de yasal yönleri tamamlanan dernek 1972’de Amerikan pediyatrik nöroşirürji birliği olarak ilk bilimsel toplantısını Cincinatti’de yaptı.
1972’de Anthony J Raimondi Dünya Pediyatrik Nöroşirürji birliği (ISPN) kuruluş hazırlıklarına başladı. İlk organizasyon toplantısını 1972’de Chicago’da, ilk bilimsel toplantısı ise 1973’de Tokyo’da Dünya Nöroşirürji birliğinin toplantısı ile birlikte yapıldı. ISPN’nin üye sayısı giderek artmaktadır. Aralarında Türkiye’nin de bulunduğu 50’yi aşkın ülkeden 450’den fazla üyesi bulunmaktadır. Bunun doğal sonucu olarak Avrupa Pediyatrik Nöroşirürji birliği (ESPN) ve ulusal birlikler (Japon, Fransız, İtalyan Pediyatrik Nöroşirürji birlikleri) kurulmuştur.
1975’de Child’s Brain ISPN’nin resmi yayın organı olarak A.J.Raimondi’nin editörlüğünde yayına başladı ve pediyatrik nöroşirürji konusunda yayınlanan ilk dergisidir. 1985 yılından itibaren Child’s Nervous System adıyla yayınlanmaktadır. Bundan sonra Concepts in Pediatric Neurosurgery, Zeitschrift Kinderchirurgie, Journal of Pediatric Neuroscience, Pediatric Neurosurgery gibi dergiler yayın hayatına başlamıştır.
Pediatrik nöroşirürjinin ilk organize olduğu Amerika Birleşik Devletleri’nde anabilim dalı veya bilim dalı olarak yapılanmış, hatta ayrı bir ihtisas dalı olması gündemdedir. Japonya’da keza aynı doğrultuda yer almaktadır. Avrupa’da bazı üniversitelerde anabilim ve bilim dalı olarak organizasyon yaygınlaşmakta olup, ayrı ihtisas konusu gündemin dışındadır.